CodonCode Aligner Sequence Assembler 3.7.1
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MD5: 47942a9d42450ff0a04625ea946182ac
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Descripción del desarrollador
"User-friendly sequence assembly and alignment"
CodonCode Aligner es un software fácil de usar para el ensamblaje de secuencias de ADN, alineación, edición de contig y detección de mutaciones. Además de las características comunes en los programas de ensamblaje de secuencias, como el recorte final, las alineaciones a las secuencias de referencia, la alineación de ADNc a ADN genómico y la exportación, CodonCode Aligner ofrece muchas características únicas que no se encuentran en otro software.Las características avanzadas de Alineador de CodonCode incluyen:
- Ensamble por nombre: construya cientos de contigs en segundos, basados en nombres de muestra
- Las secuencias de consenso precisas basadas en cualidades de secuencia eliminan la necesidad de editar discrepancias triviales
- Contigs de contigs: alinee contigs entre sí con ClustalW y vuelva a las trazas subyacentes con un simple doble clic
- Automatice con procesamiento de un solo paso y scripts
- Análisis de mutación sensible con herramientas únicas para analizar inserciones y deleciones heterocigotas
- Use herramientas líderes como Clustal, MUSCLE, Phred & Phrap dentro de CodonCode Aligner
- Obtenga una mejor visión de sus secuencias ABI con la nitidez de seguimiento de CodonCode Aligner
- Observe las diferencias con la tabla de diferencias y el zoom en contigs
- Construye árboles vecinos para ordenar tus muestras por diferencias
CodonCode Aligner es fácil de aprender y usar, pero potente y altamente personalizable. Incluye una amplia ayuda sensible al contexto con instrucciones "explicativas" y explicaciones sobre los algoritmos utilizados. CodonCode Aligner es ampliamente utilizado en filogenética, investigación de evolución, biogeografía, detección de mutaciones y otras áreas de investigación biomédica.
La descarga es una versión de prueba que es completamente funcional durante 30 días. Se puede convertir a una versión completa comprando una licencia. Las licencias para CodonCode Aligner son sustancialmente menos costosas que las licencias para paquetes de software comparables. Las licencias "flotantes" están disponibles sin costo adicional y se pueden compartir entre Windows y Mac OS X.
Requisitos: Windows 2000 or newer, Mac OS X 10.4 or newer
Que hay de nuevo en esta version:: New: Neighbor-Joining trees Zooming in alignments & assemblies Automatic reference sequence shortening after alignments Mask low coverage regions New and flexible consensus methods Set base numbers Automatic name scheme definitions for "Assemble & Align by Name" Customize toolbars directly through popup menus Rebuild the consensus See http://www.codoncode.com/aligner/new.htm
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